基因改造黃豆經過國際許多專家及團體反覆的實驗證實是安全的，這是超過130項研究，涵蓋超過300個研究小組，歷時25年的研究成果。基因改造技術與傳統植物育種相比有更高的精確度、可預測性及安全保障。

基因改造黃豆與非基因改造黃豆相比擁有等同的安全性、營養組成分及遺傳表現，此稱之為實質等同。它含有人體所需的營養成份，例如：蛋白質、脂質、卵磷脂、纖維、礦物質、維生素以及異黃酮素…等。進行基因改造主要是添加了使黃豆可以抗除草劑、防蟲害等的基因特質，而並非將黃豆原本含有的營養成份移除。因此基因改造黃豆與非基因改造黃豆的營養價值是實質等同的。

基因改造黃豆是經濟又實惠的，最主要是因為它降低了生產成本，所以使用生物技術的作物，通常要比使用傳統技術生產作物的成本還要低。